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含有抗菌药物的牙膏和抗菌牙刷的原理主要是通过添加抗菌药物成分来达到抑制或杀灭口腔中的细菌，从而改善口腔健康状况。
抗菌牙膏中的抗菌药物成分可以渗透到牙菌斑中，抑制细菌的生长繁殖，甚至直接杀灭细菌，这些成分通常具有抑菌作用，能够减少牙龈炎和牙龈出血等问题，抗菌牙刷则通过特殊的刷毛设计和材质选择，更好地清洁牙齿和牙缝中的细菌，同时刷毛的柔软度和硬度适中，能够按摩牙龈，促进血液循环，抗菌牙刷的刷毛可能经过抗菌处理，本身具有一定的抗菌能力。
这些产品的主要目的是减少口腔中的细菌数量，降低口腔疾病的风险，这些产品并不能完全替代药物，如果口腔健康状况出现问题，应及时寻求医生的帮助，对于抗菌药物的长期使用，也需要遵循医生的建议，避免滥用和误用，平时更应注意口腔卫生习惯，定期刷牙、使用牙线、定期洁牙等，以维护口腔健康。